Cortex Strikes Back est un jeu de plateforme où le joueur incarne Crash Bandicoot. Le but du jeu est de rassembler 25 cristaux pour le Docteur Neo Cortex, l'ennemi juré de Crash. Ces cristaux sont disséminés dans 25 niveaux différents , accessibles via des « salles de téléportation », qui servent de hubs au jeu. [ 1 ] Un niveau est terminé lorsque Crash collecte le cristal correspondant et atteint le bout du chemin, ce qui le ramène à la salle de téléportation. [ 2 ] Chaque salle de téléportation contient cinq niveaux. Une fois les cinq niveaux terminés, le joueur doit vaincre un boss pour accéder à la salle de téléportation suivante. Le joueur dispose d'un certain nombre de vies , qu'il perd lorsque Crash est attaqué par un ennemi ou tombe à l'eau ou dans un trou. Si le joueur n'a plus de vies, la partie est terminée.